中医系党总支下设教工党支部、学工党支部两个支部。现有师生党员45名，其中教职工党员12名，学生党员33名。
中医系党总支坚决贯彻执行党的路线、方针、政策，积极按照学校党委的要求及基层党组织工作条例开展工作，参与讨论和决定本单位教学、行政管理及科研活动中的重要事项，支持系行政领导在其职责范围内独立开展工作。多年来，中医系党政领导班子团结和协、互相支持，有着坚强的凝聚力和战斗力，形成了系的领导核心，真正发挥了基层党组织的政治核心作用和战斗堡垒作用。
在思想建设方面，经常对师生进行马列主义、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要思想及科学发展观的教育，学习的党的基本理论、基本路线、基本经验以及党史、法制、政策。在学习教育活动中能紧密结合教职工教学、科研等工作实际和学生学习、生活思想状况等实际有针对性地展开，对教职工主要是加强政治理论素质教育和敬业爱岗的职业道德教育；对学生主要是加强政治理论、思想品质、专业思想、学习动机及社会公德和人生目的、远大理想教育。各支部均将民主生活会制度化，定期开展批评与自我批评，畅说欲言、肯定成绩、查找不足，从而达到高度团结，统一认识、统一步调。
在组织建设方面，严格按照党员发展标准，从新生抓起，坚持以早教育、早育苗、早培养，及时发展的思路制定了严格的培养考察发展的工作程序。经过几年的工作，党员队伍不断发展壮大，做到了数量和质量的和谐统一，保证了党组织的健康和稳定发展。另外还加强了对入党积极分子的培养，除开设了培训班，让他们对党的基本知识进行系统的学习外，还积极组织他们开展各种社会实践活动。
在作风建设方面，首先注重领导班子的团结合作，互相支持配合，大事小事常沟通，做到勤政、廉洁、克己奉公、为系、教职工、学生谋利益。为了不断提高理论水平和领导能力，经常组织大家学习理论和政策，进行调查研究，把教学质量、科研水平、学生成才作为中心工作，把系发展作为第一要务，注重质量、规模，双提高。对教职工倡导求真务实的工作作风，把服务意识和奉献精神真正体现在每一项具体工作中，教职工对工作都有高度的责任心，精心备课、认真讲授，表现出了吃苦耐劳、扎实工作的敬业精神。对学生倡导努力学习、勤奋锻炼、力争上游、早日成才，特别是党员和入党积极分子都能起表率作用。
在廉政建设方面，坚持抓党风廉政建设责任制，形成了党政齐抓共管的工作局面，按照廉政建设责任制的要求总支书记担任第一责任人，其他成员抓好分管部门的工作。在重大事项上进行事前、事中、事后全程监督，避免了违纪违法问题发生。
