系党总支书记在总支部委员会的集体领导下，负责主持党总支的日常工作，其主要职责是：
一、负责召集总支委员会和总支部大会；及时传达党和国家的各项方针、政策及学校各项决定，组织师生员工认真学习，深刻领会，变为师生员工的自觉行动。
二、统筹安排党总支工作，将党总支工作中的重大问题，及时提交总支部委员会和总支部大会决定。
三、认真抓好党总支自身建设，增强凝聚力、吸引力和战斗力。认真组织党员学习马列主义、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要思想，学习党的知识，坚定共产主义信念，坚持坚定正确的政治方向。认真开展批评和自我批评，充分发挥党员的先锋模范作用。动员党员关心群众生活做好“教书育人”工作。
四、认真贯彻“坚持标准、保证质量、改善结构、慎重民展”的方针，做好党员发展工作。对发展对象的政治觉悟、思想品德和入党动机进行严格考察，对预备党员加强教育和考察并及时组织讨论其转正问题。
五、积极支持系主任在其职责范围内独立负责地开展工作，认真参与系教学、科研、行政管理、学生管理等重大问题的讨论、决定，动员党员以实际行动贯彻执行系行政领导的正确决定，并在实施过程中做好保证监督作用。
六、认真做好本系干部的培养、使用、考察工作，会同系主任就系内干部的任免权限报批。做好本系在选派人员出国、晋级、晋职、评奖等方面的政治审查，严格把好政治关。
七、领导全系的思想政治工作。按学校要求并结合本系的实际，认真组织政治学习开展思想政治教育工作，会同系主任经常督促检查专职辅导员的工作。做好思想政治工作的经验交流和总结工作。
八、协同系行政领导抓好毕业生就要教育和新生录取及入学教育工作。
九、对本系工会、共青团、学生会等群众组织实施政治领导。定期研究系工会、共青团、学生会的工作，充分发挥他们的作用。
十、认真执行党的统战政策和知识分子政策，要善于同非党干部和民主党派人士合作共事，搞好互相监督。
